O Conselho da Comunidade Educativa (CCE) - cujas composição e competência estão previstas nos Artigos 11.º e 12.º da Portaria que regulamenta a Escola Profissional Dr. Francisco Fernandes (552/2024) -, tem a faculdade de requerer aos restantes órgãos as informações necessárias para a realização eficaz do acompanhamento e a avaliação relativa a todo o funcionamento da instituição educativa, bem como de lhes dirigir recomendações, com vista ao desenvolvimento do projeto educativo e ao cumprimento do plano anual de escola.
Este órgão reúne ordinariamente duas vezes por ano letivo e extraordinariamente sempre que seja convocado pelo respetivo Presidente, por sua iniciativa ou a requerimento de um terço dos seus membros em efetividade de funções ou por solicitação do Diretor.
O docente Paulino da Costa Abreu foi designado Presidente do CCE pelo período de 3 anos, com efeitos a 18 de setembro de 2026, de acordo com o despacho em anexo.