A Região Autónoma da Madeira, através da Secretaria Regional do Ambiente e Recursos Naturais, integra o Grupo de Trabalho para as Áreas Marinhas Protegidas (GT-AMP), coordenado pelo Ministério do Mar. O GT-AMP envolve entidades do Continente e das Regiões Autónomas com distintas competências e valências na área do mar, desde Ministérios (Mar, Negócios Estrangeiros), instituições de caráter técnico-científico (Instituto Hidrográfico, Instituto Português do Mar e da Atmosfera, Instituto de Conservação da Natureza e Florestas), Universidades e ONG’s (Fundação Oceano Azul, SPEA), que tem por principal objetivo a produção de um documento de base que avalie e oriente o processo de criação da Rede Nacional de Áreas Marinhas Protegidas.